GWAS gen mã hóa họ protein F-box trong cây khoai lang
Nguồn: Hanna Amoanimaa-Dede, Zhengwei Shao, Chuntao Su, Akwasi Yeboah, Hongbo Zhu. 2022. Genome-wide identification and characterization of F-box family proteins in sweet potato and its expression analysis under abiotic stress. Gene; 2022 Apr 5; 817:146191.
Theo nghiên cứu này, định tính mang tính chất “genome-wide”của họ protein F-box trong cây khoai lang mang lại kết quả là 243 gen IbFBX, phân bố không đều trên 15 nhiễm sắc thể của hệ gen cây khoai lang. sự lặp đoạn của gen (gene duplication) được phân tích cho kết quả: có sự segmental duplication (tái bản nhiều lần đoạn nhiễm sắc) như là yếu tố chủ yếu ảnh hưởng đến sự tiến hóa của khoai lang, đặc biệt tiến hóa của họ gen IbFBX. Phân tích di truyền huyết thống đã tập họp được nhóm gen mã hóa F-box proteins của cây kjhoai lang, cây Arabidopsis, và cây lúa thành sáu clades (I-VI). Phân tích kiến trúc gen đích IbFBX cho thấy hầu hết các gen như vậy trong cùng một clade được bảo tồn ở mức độ rất cao. Phân tích phổ biểu hiện gen của họ gen IbFBX tại 9 mô tế bào khác nhau và trong nghiệm thức xử lý stress: các gen IbFBXs điều tiết theo kiểu “up” rất mạnh mẽ hoặc điều tiết theo kiểu “down” khi phản ứng với stress mặn và khô hạn, cho thấy vai trò rất có ý nghĩa của phản ứng với stress phi sinh học và sự thích ứng với môi trường của cây. Hiểu biết về chức năng đa dạng và thành phần biểu hiện đa gạnng của IbFBXs đưa ra cơ sở lý thuyết vững chắc về định dạng chức năng (annotating the functions) của IbFBXs. Về lâu dài, kết quả sẽ giúp cho việc chọn giống ở mức độ phân tử cây khoai lang thuận tiện hơn.
Xen: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35026290/
Hoặc https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378111922000105?via%3Dihub
